Il-Maqluba (1)Is-Simar (2)Il-Wied ta' San Martin and Il-Ballut (3)Għajn Barrani (4)The Saline Marshland of il-Magħluq ta' Marsaxlokk (5)Wied ix-Xlendi and Wied il-Lunzjata (6)Għajn Riħana Valley System (7)L-Għadira, Mellieħa (8)Qortin Isopo, Nadur (9)Ħarq Ħamiem Cave (10)Wied tal-Kalkara and Wied ta' Rinella (11)Coastal Cliffs of mainland Malta (12)Filfla (13)Il-Ġebla tal-Ġeneral (14)Ħarq Ħamiem Valley (15)St. Paul's Islands (16)Ta' Ċenċ Important Bird Area (17)Wied Blandun (18)Wied il-Kbir and Wied Għomor (19)Wied ta' Mġarr ix-Xini (20)
Wied Musa (21)
Buskett (22)
Il-Gebla tac-Cawl (23)
Il-Gebla tal-Ħalfa (24)
L-Għadira s-Safra (25)
Pembroke Coastal Platform (26)
Qortin tal-Magun (27)
Ramla l-Ħamra (28)
Salini (29)
Tas-Sellum Inland Cliffs and Caves (30)
Dwejra/Qawra Area (l/o San Lawrenz and Kerċem) (31)
Il-Qattara permanent freshwater pool (32)
Shingle Beach at il-Qawra Inland Sea (33)
Wetland at Tal-Port (34)
Wied Għorof/Wied Merell (35)
Wied il-Kbir/Wied Pisklu and Tributaries (36)